Avrupa kupaları tarihinde bugüne dek 21 eleme mücadelesine çıkan sarı-lacivertliler, 7 kez de rakiplerine elenmekten kurtulamadı.

UEFA Şampiyonlar Ligi'ne katılabilmek için 14 kez ön eleme oynayan sarı-lacivertliler 8 kez tur geçti, 6 elemede ise tur atlayamadı. Sarı-lacivertliler, UEFA Kupası ve UEFA Avrupa Ligi için mücadele ettiği 7 ön eleme turunda ise sadece bir kez kupa dışında kaldı.UEFA Şampiyonlar Ligi'nde eleme turlarında 2002-2003 sezonunda Hollanda'nın Feyenoord, 2006-2007 sezonunda Ukrayna'nın Dinamo Kiev, 2010-2011 sezonunda İsviçre'nin Young Boys, 2012-2013 sezonunda Rusya'nın Spartak Moskova, 2013-2014'te İngiltere'nin Arsenal ve 2015-2016'da Ukrayna'nın Shakhtar Donetsk takımları karşısında turu geçemeyen Fenerbahçe, UEFA cephesinde ise 2010-2011 sezonunda Yunanistan'ın PAOK takımı karşısında play-off'ta elenmişti.

- Şampiyonlar Ligi'nde 28 eleme maçı oynadı

Fenerbahçe, Avrupa kupaları tarihinde UEFA Şampiyonlar Ligi'ne katılabilmek için 28 eleme maçına çıktı. Şampiyonlar Ligi elemelerinde yaptığı 28 maçta 11 galibiyet elde eden Fenerbahçe, 9 beraberlik yaşadı, 8 yenilgi aldı.Sarı-lacivertli ekip, Şampiyonlar Ligi'ndeki elemelerde 43 gol atarken, kalesinde 31 gol gördü.Fenerbahçe, UEFA Şampiyonlar Ligi ön elemesinde oynadığı son 4 maçta kazanamadı. Sarı-lacivertliler 2013-2014 sezonu play-off turunda Arsenal'e 3-0 ve 2-0 yenildi. Geçen sezon ise Shakhtar Donetsk'le sahasında 0-0 berabere kalan Fenerbahçe, deplasmanda rakibine 3-0 yenilerek kupa dışında kalmıştı.Fenerbahçe, bu aşamada en son 2013-2014 sezonu 3. ön eleme turunda Avusturya'nın Salzburg takımını 6 Ağustos 2013'te mağlup etmişti.