Trabzon Valiliği, Vakıflar Genel Müdürlüğü, Trabzon Kültür Varlıklarını Koruma Bölge Müdürlüğü ile Trabzon Büyükşehir Belediyesi'ne Fatih Mahallesi Muhtarlığı adına Zeki Batar, Ayasofyalılar Yardımlaşma Dayanışma ve Güzelleştirme Derneği adına Başkan Mustafa Bal, Trabzon Sanat Evi Derneği adına Başkan Adnan Taç, Trabzon İli ve İlçeleri Eğitim Kültür ve Sosyal Yardımlaşma Vakfı adına Bilgin Aygül, Mimarlar Odası Trabzon Şubesi adına Başkan Sayim Adanur imzasıyla yapılan başvuruda, Ayasofya'nın korunması gerekli bir kültür varlığı olduğuna vurgu yapıldı. Çeşitli düzenlemelere göre bu alanlarda herhangi bir işlemin Koruma Kurulu iznine bağlı olduğu vurgulandı. Şikayet metninde şu ifadeler kullanıldı: “Trabzon Ayasofya Kilisesi’ne ilişkin olarak Koruma Kurulu’nun müze kullanımı kararında herhangi bir değişiklik olup olmadığı, yapıdaki inşai ve fiziki müdahaleler için izin ya da kurul tarafından bu müdahalelerin dayanağı olabilecek bir karar alınıp alınmadığı konusunda 4982 sayılı Bilgi Edinme Hakkı Kanunu uyarınca yasada belirtilen süre içinde bilgi verilmesini, söz konusu yapıda eski eserin özelliğini kaybetmesine yol açan müdahalelerin dayanağı olabilecek bir işlem söz konusu değil ise izinsiz müdahalelerin durdurulmasını ve suç teşkil eden bu fiilleri gerçekleştirenler hakkında 2863 Sayılı Yasa’ya aykırılıktan dolayı Cumhuriyet Savcılığı’na suç duyurusunda bulunulmasını arz ve talep ederiz.”